鱼种不同，生活的水层也不同。鲫鱼、鲤鱼、鲇鱼生活在水的下层；草鱼、鲢鱼、鳙鱼生活在水的中层；而翘嘴鲌、鲦却生活在水的上层。这主要是因为不同的鱼对氧气的需求量不同，也叫耐氧力的差异。水中氧气的分布并不均匀，下层少，上层多。
由于鲫鱼、鲤鱼耐氧力强，生活在哪里都行，但水底的食物较丰富，所以爱在下层生活。鲢鱼、鳙鱼的耐氧力差一些，在水底因为需求的氧气不足，所以自然不乐意在水底生活，加之它们吃食的方式是滤食，以浮游生物为主，而水中上层的浮游生物多于水的下层，所以它们选择水的中层或上层生活。翘嘴鲌、鲦鱼的耐氧力更差，所以在氧气相对比较丰富的水上层生活。钓鱼人都知道，钓了条鲌鲦鱼，不一会就会死，而鲫鱼可以带回家，即使是夏天，回家后有的鲫鱼还活着，这说明鲫鱼的耐氧力最强。了解鱼在各水层生活的特征，钓鱼人才能有针对性地施钓。钓鲫鱼，应当把钩沉到水底；钓鲌鱼，钩下在水的上层。由于鱼生活在不同的水层，所以才产生了底钓、悬钓、浮钓的不同钓法，也使钓具各具特色。
生活在水中层的鱼主要是鲢鱼、鳙鱼、草鱼等，翘嘴鲌有时也生活在中层水域，尤其是鲢鱼、鳙鱼，很少到水的深水底层。小鲦、鲢鱼以生活在水的上层为主，因为它们的食物来源主要是漂浮在水面上的浮游生物、藻类植物及从水边的树上、庄稼地里被风吹进水中的种子、果实、小虫等。鱼也不会绝对生存在某个水层，它会随着季节的变化而变化。这些情况对垂钓者来说十分重要。在什么季节钓什么鱼，应考虑到这时鱼会在哪个水层中生活。鱼有没有固定的窝呢？钓鱼人都想在垂钓中能把饵投到鱼窝中，如能这样，会有惊喜的收获。准确地讲，大多数鱼是没有固定窝的。
在冬季，鱼为了避寒会在水底的坑洼处卧泥不动。到了春暖花开，鱼就会游走，“哪里合适哪里就是家”，这个“合适”包括以下条件：一是温度合适。春天气温回升，浅水区水温回升快，鱼就到浅水区“安家”。夏天，水温高，鱼就游到水温较低的深水区。二是水的溶氧量。由于气温及其他原因，水的溶氧量也会变化，鱼会寻找溶氧量相对大的水域。三是水生植物。水生植物与鱼的生活有密切关系，有水生植物的地方也常常是鱼的家，如特别喜爱水草的草鱼，有草的地方就成了草鱼的“窝”。
同一个水域，若一边靠近道路，人来车往，不安静，鱼自然避而远之，会到较为安静的水域生活。有些桥墩下，涵洞附近，畜禽经常下水的地方，也是鱼喜欢栖息的区域。由于水温、天气、水量大小变化的原因会使鱼“窝”发生变化，如水库、湖泊中的鱼常在岸边靠近庄稼地的水域栖息，因为这些地方是它们的食物来源地。